Die Geschäftsleitung führt im Auftrag des Verbandsvorstehers die laufenden Geschäfte des KRZN. Sie leitet und organisiert den inneren Dienstbetrieb, stellt den Haushaltsplan auf und berichtet den Gremien regelmäßig über die Lage des Zweckverbandes. Sie ist für eine wirtschaftliche Aufgabendurchführung verantwortlich.
Jonas Fischer ist seit Januar 2009 Geschäftsleiter des Kommunalen Rechenzentrums Niederrhein.
Jochen Müller ist seit Juni 2019 stellvertretender Geschäftsleiter und seit Oktober 2020 Verbandskämmerer.